Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SHANK2Q9UPX8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SHANK2Q9UPX8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHANK2Q9UPX8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHANK2Q9UPX8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHANK2Q9UPX8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHANK2Q9UPX8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHANK2Q9UPX8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHANK2Q9UPX8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHANK2Q9UPX8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHANK2Q9UPX8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHANK2Q9UPX8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHANK2Q9UPX8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHANK2Q9UPX8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHANK2Q9UPX8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHANK2Q9UPX8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHANK2Q9UPX8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHANK2Q9UPX8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHANK2Q9UPX8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHANK2Q9UPX8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms