Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF9BQ9UPX0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms