Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP1Q9UPQ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AGAP1Q9UPQ3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms