Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCAF8Q9UPN6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms