Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC12A4Q9UP95 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms