Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN11Q9UMQ6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms