Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI0

ATAD2B, ATPase family AAA domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2BQ9ULI0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
ATAD2BQ9ULI0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
ATAD2BQ9ULI0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
ATAD2BQ9ULI0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
ATAD2BQ9ULI0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
ATAD2BQ9ULI0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
ATAD2BQ9ULI0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
ATAD2BQ9ULI0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
ATAD2BQ9ULI0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
ATAD2BQ9ULI0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
ATAD2BQ9ULI0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
ATAD2BQ9ULI0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
ATAD2BQ9ULI0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
ATAD2BQ9ULI0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
ATAD2BQ9ULI0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC39.26■■■■□ 3.88
ATAD2BQ9ULI0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
ATAD2BQ9ULI0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
ATAD2BQ9ULI0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ATAD2BQ9ULI0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ATAD2BQ9ULI0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms