Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms