Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C4Q9UKN8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms