Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM4Q9UKN5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM4Q9UKN5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms