Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GGA1Q9UJY5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GGA1Q9UJY5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms