Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC23Q9UJX2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms