Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSR3Q9UJK0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms