Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC5Q9UII4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms