Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms