Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTNNA3Q9UI47 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTNNA3Q9UI47 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms