Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO40Q9UH90 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO40Q9UH90 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms