Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEF1Q9UBV8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEF1Q9UBV8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEF1Q9UBV8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEF1Q9UBV8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEF1Q9UBV8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms