Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PHRF1Q9P1Y6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms