Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2L1Q9P0L9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2L1Q9P0L9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms