Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC59Q9P031 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC59Q9P031 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC59Q9P031 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms