Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU0

FLRT3, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT3, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLRT3Q9NZU0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FLRT3Q9NZU0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FLRT3Q9NZU0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FLRT3Q9NZU0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FLRT3Q9NZU0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FLRT3Q9NZU0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FLRT3Q9NZU0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FLRT3Q9NZU0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FLRT3Q9NZU0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FLRT3Q9NZU0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FLRT3Q9NZU0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FLRT3Q9NZU0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FLRT3Q9NZU0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FLRT3Q9NZU0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FLRT3Q9NZU0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FLRT3Q9NZU0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FLRT3Q9NZU0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms