Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms