Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms