Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXC10Q9NYD6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC10Q9NYD6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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