Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms