Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BARHL2Q9NY43 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms