Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX58

LYAR, Cell growth-regulating nucleolar protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYARQ9NX58 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LYARQ9NX58 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYARQ9NX58 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms