Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf42Q9NWW7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf42Q9NWW7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf42Q9NWW7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf42Q9NWW7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf42Q9NWW7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms