Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
NLE1Q9NVX2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLE1Q9NVX2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 785.1 ms