Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L1Q9NU39 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms