Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms