Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF4Q9NR80 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
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