Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C8orf4Q9NR00 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms