Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB3Q9NQW8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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