Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSU72Q9NP77 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms