Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 765 ms