Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC52A2Q9HAB3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC52A2Q9HAB3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms