Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLMPQ9H6B4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLMPQ9H6B4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms