Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF3Q9H4W6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms