Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SENP3Q9H4L4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SENP3Q9H4L4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms