Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HIPK3Q9H422 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms