Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBPF3Q9H094 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBPF3Q9H094 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms