Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GFRA4Q9GZZ7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA4Q9GZZ7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms