Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIF3L1Q9GZT8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms