Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PDGFDQ9GZP0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDGFDQ9GZP0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDGFDQ9GZP0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms