Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms