Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H5

ARHGAP39, Rho GTPase-activating protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP39Q9C0H5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGAP39Q9C0H5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGAP39Q9C0H5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms