Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LNPKQ9C0E8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LNPKQ9C0E8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms