Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E4

GRIP2, Glutamate receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP2Q9C0E4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIP2Q9C0E4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP2Q9C0E4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms